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047|精准医疗第一步:人类基因组测序

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发表于 2017-11-13 08:51:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
047|精准医疗第一步:人类基因组测序
昨天我们介绍了精准医疗的一些基础情况。今天我为大家介绍一个基因组测序和合成生物学的划时代人物——Craig Venter,看看他的人生轨迹,看看他是怎么和基因测序以及精准医疗发展联系在一起的。
让Venter享誉全球的,是他身上的两个“标签”:
·       第一个标签,是他成立了私人公司,自己做全基因组测序,直接挑战了人类基因组计划,要知道,这个计划是6个国家的20多个高校一起在搞的,其中中国也有参与,但是到最后胜出的是Venter的私人公司。
·       第二个标签,是他带领团队成功地把一个合成的基因组转移到了细胞里,这是全球第一个。
Venter和大多数默默无闻的科学家不同,他个性张扬,常常把自己的研究放在聚光灯下。他先后创建了Celera Genomics、基因组研究院和J. Craig Venter 研究院,被外界称为“科学狂人”。

一、“科学狂人”的成长之路
Venter是怎么一步步成为“科学狂人”的呢?我们先看看他的成长之路。
Venter出生在美国犹他州的盐湖城。年轻的时候,他反对越战,但是还是参了军,在越南的一个战地医院里工作。在越战期间,他看透了生死,要了结自己,所以就往深海里游,想着游到没劲儿了把自己淹死。结果等他到了深海,发现自己被一群鲨鱼给包围了。在挣扎过程中,他突然改变了自己的想法,觉得生命和死亡是紧紧相连的,如果自己能有更多的知识,就能挽救更多战友的生命。就这样,Venter放弃了轻生,决定从事医学研究。看来鲨鱼也看出了他的未来价值,舍不得把他当成一顿午餐吃掉。
回到美国以后,他先从加州大学圣迭戈分校拿到了生物化学本科学位,后来又拿到了生理学和药物博士学位。毕业之后,Venter先是在纽约州立大学布法罗分校任副教授,后来又转到国立健康研究所NIH,成为一名研究员。

二、用“鸟枪法”完成人类基因组测序
在NIH工作期间,CraigVenter参与了一个叫做“人类基因组计划”的项目,从此和人类基因结下了不解之缘。
人类基因组计划是一个国际性的科学研发项目。它的目标是把DNA上面的碱基对的序列排列搞清楚,并且鉴定出每一段基因的功能和位置。周一时我们讲到,人类基因有四种不同的碱基,然后按照一定的顺序排列而成。人类基因组计划,就是想把我们人类基因上足足30亿个碱基对给排出来。这个计划从初步实施到最终宣布完全排列成功,持续了整整20年,有美国、英国、日本、法国、德国、加拿大和中国的20多个高校参与。可以想象这是一个多么庞大的计划。
简单介绍完人类基因组计划之后,我们再回到Venter所取得的成就上。Venter最开始参与人类基因组计划,一直觉得一种叫鸟枪测序的方法能够又快又有效地测出人类基因组。这里所说的鸟枪法,又叫散弹法,它的过程就是把DNA像散弹一样随机地处理成大小不同的片段,然后再把这些片段的序列连接起来。但是基因组专家觉得人类基因组太复杂,而鸟枪法又不够精确,所以就拒绝了这个方法。
但是Venter对鸟枪法非常执着,人类基因组计划还没完成,他就开始找一些私营部门来资助他,想实现这个技术手段。1998年,他创建了他的第一个公司 Celera Genomics,仅仅用了两年的时间,就完成了人类基因组的排列顺序。此外,Venter还在这里测出了自己的所有的DNA序列。Venter也因此成为世界上第二个全部测出自己的基因组序列的人。
说来有趣,CeleraGenomics是当时世界上唯一一个跟人类基因组计划并行在做基因测序的公司,而且最终还走在了前面,赶到“六国联军”之前完成了人类基金组测序的全部工作。这给那些国立的健康研究所造成了很大的压力,直接推动他们开始对整个基因组进行全测序。
从这里我们也可以看出Venter的影响力。一个私有部门因为技术新、效率高,倒逼公共部门改进并做好自己的技术。这点非常值得我们中国的民营企业,尤其是想在创新上有更好发展的企业借鉴。不要总觉得只要是国家队的就是好的、先进的。在科技创新这一块,从制度上和调度人的主观能动性上来看,新技术和新思想都来自小公司,这已经在国际上被反反复复证明过很多次了。

三、合成基因组公司:扩展人类对生命的认知边界
和世界上很多伟大的科学家或者连续创业者一样,Venter有着强烈的想要改变世界、影响世界的愿望。这种强烈的精神支柱,支撑着他不断探索技术和科学的边界。因此,除了上面提到的基因测序之外,Venter还做出了很多伟大的成就。
目前,Venter是以他本人命名的J.Craig Venter研究院的总裁, 主要从事合成生物学的研究。而早在2005年6月份,他就和合作伙伴一起创建了合成基因组公司。这个公司的目标就是用基因修改过的微生物来执行一些具体的反应,比如创造清洁能源、生化药品。为了研发下一代生物燃料,2009年,埃克森美孚石油公司还宣布与这家公司合作,投了六亿美元。
接着,在2010年5月,Venter带领的科学家团队,创造出了所谓的合成生命。这个合成生命,主要是通过提取现有的DNA,然后合成一段新的DNA,然后在DNA当中再嵌入一整条细菌的基因组,再把这段新的DNA移植到另一个细胞里面去。因为这是全球第一个利用化学物质合成基因组的活细胞,所以意义非凡。
不过,Venter并没有就此停止研究合成细胞的脚步。
2016年,Venter创造出了新的合成生命,这是一个只有473个基因的合成基因组,是有史以来基因最少的生命体。他的目标是让有机体的基因尽量少,少到只要能让一个有机体活着就行了。通过这种尝试,搞清楚到底哪些基因是最本质的,然后下一步人类就可以开始探索用更简单的成分来合成生命了。
当然,从这里我们也能看出,精准医疗还有很长的路要走。
人类有数万个基因,Venter创造的合成基因组生命,虽然只保留了必要的473条基因,然而这其中仍然有三分之一的基因是未知的。这些基因的功能是什么,基因发生突变后我们该采取什么解决方案,这些依然是摆在科学家们面前的难题。
今天,71岁的Venter仍然在探索基因的奥秘。2014年, Venter和奇点大学联合创始人Peter Diamandis、美国制药巨头Celgene的前任CEO Robert Hariri,联合创建了人类长寿公司,叫Human Logevity,把延长人类寿命作为公司目标。可以说,我们人类对自身的探索才刚刚起步,而正是有Venter这样的科学家,他们肩负着探索生命科学的使命,孜孜不倦地扩展人类对生命的认知边界,人类的生命质量才有了提升的空间。

今日知识小结
今天我们介绍了基因和基因排序的先锋人物Craig Venter以及他取得的伟大成就,我希望你能理解以下三点:
1.    牛人一般都有一个不平凡的人生,这取决于他个人的心理变化。当他对社会做出了贡献以后,这个使命感会促使他继续做出更大的贡献。而这种由使命感所驱动的,对社会产生积极影响的态度,值得我们每个人学习。也许你就是下一个伟大的,对世界做出伟大改变的不平凡的人。
2.    在科技创新层面,很多人以为国家队容易走在前面,但实际上国家队很多时候只是跟跑的,它们看上去像个庞然大物。其实很多新技术和新思想都来自于小公司。所以,一方面,不要盲目迷信国家队;另一方面,中国的民营企业也要敢于走在国家队前面。
3.    人类对于生命的认知还非常浅显,测出人体全基因组只是迈向精准医疗的第一步,每个基因有什么样的功能、基因产生突变后怎么治疗,都是科学家需要摸清的方向。人类对于生命的探索还有很长的路要走。

今日思考题
你觉得Venter作为一个科学家,别人所认为的“狂”体现在什么层面上?你觉得还有哪些这样的“狂人”改变了世界?
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